Dal 1996 la Fondazione ha ottenuto dall'ONU il riconoscimento dello status consultivo in qualità di Organizzazione non Governativa presso l'ECOSOC (Consiglio Economico e Sociale delle Nazioni Unite). Ciò significa che la Fondazione Falcone svolge funzioni consultive nell'ambito delle materie ricadenti all'interno della competenza del Consiglio Economico e Sociale (ECOSOC) con riferimento ai campi dell'economia internazionale, delle problematiche sociali, culturali, educative, di salute, scientifiche, tecnologiche ed alle questioni dei diritti umani.
La Fondazione è amministrata da:
- Consiglio Generale: composto da 11 a 50 membri (attualmente sono 32);
- Comitato Esecutivo: sono membri di diritto quei fondatori che fanno parte del Consiglio Generale stesso e il Presidente della Fondazione;
- Presidente della Fondazione: ha la rappresentanza legale della Fondazione e provvede alla sua amministrazione in conformità con quanto deliberato dal Consiglio Generale;
- Collegio dei Revisori dei Conti: è composto di 3 membri effettivi e due supplenti
